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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

美国停飞航班逐步恢复 拜登下令彻查原因！******

　　中新网1月11日电 综合报道，当地时间11日，因电脑系统故障导致美国各地航班受到停飞影响，美国联邦航空管理局(FAA)最新发文称，停飞航班现已开始恢复运营。白宫新闻秘书卡琳·让-皮埃尔在社交媒体推特发文称，拜登总统指示交通部进行全面调查。

　　据英国广播公司(BBC)报道，当地时间11日上午9点，FAA发文称，目前强制停止所有美国离港航班的禁令已解除，FAA将继续调查故障原因。

　　白宫新闻秘书卡琳·让-皮埃尔当天也在社交媒体推特发文称，美国总统拜登上午听取了交通部长关于美国联邦航空局系统故障的简报。

　　“目前没有证据显示故障是由于网络攻击造成，但总统指示交通部进行全面调查，”皮埃尔写道。

　　据悉，拜登早些时候对记者说，FAA目前并不知道是什么原因导致了电脑故障。“(FAA)在几个小时内会好好了解故障原因，我们会在那个时候做出回应，”拜登说道。

　　当天早些时候，因电脑通知系统故障导致美国各地航班受到影响，美国联邦航空管理局(FAA)随后下令，美国所有航空公司暂停境内航班起飞。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）